صمّمت الشعار السيدة الزي زوجة الدكتور البريطاني هاري سندرسن الذي تولّى منصب العميد الأول للكلية عند تأسيسها، مستلهمةً في تصميمه الرموز التاريخية والحضارية لبلاد الرافدين.
ويرمز الشعار إلى نهري دجلة والفرات، اللذين يلتقيان ليشكّلا شط العرب، فيما يتوسط النهرين كتابٌ مفتوح تتسلّق صفحاته حيةٌ، بوصفها رمزاً للطب والشفاء.
وعلى جانبي شط العرب، يظهر الثوران المجنحان، في إشارة إلى عراقة حضارة وادي الرافدين وأصالتها وامتداد جذورها التاريخية، وما بلغته الحضارة من مكانة وإرث حضاري عريق.
ويجسّد الشعار، بتكويناته ورموزه، التقاء العلم والمعرفة بالطب، وارتباط رسالة الكلية بتاريخ العراق وحضارته العريقة.